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Research Record

计算机断层成像

Computed Tomography

研发面向小动物与离体样品的高分辨率micro-CT系统、快速重建和骨骼定量分析软件。

High-resolution micro-CT systems, GPU-accelerated reconstruction, and quantitative bone analysis for small-animal and ex-vivo imaging.

实验室研发的micro-CT成像系统

Micro-CT成像系统简介

小动物高分辨率micro-CT成像系统专门针对小鼠、大鼠及小兔子等小动物活体样品成像需要而设计,同时可以对生物离体样品进行高分辨率扫描成像和定量分析。

系统采用微焦点X射线源和高分辨率平板探测器,具有成像分辨率高、扫描速度快、多级成像视野可调等优势;在图像三维重建方面,采用GPU加速技术实现快速三维重建,同时配备专门的骨分析软件,实现骨密度定量和骨小梁形态结构分析。整体系统占地空间小、操作灵活,自带射线屏蔽,使用安全。

  • 成像分辨率高;
  • 支持多帧叠加,提升对比度;
  • 多级成像视野,适合不同尺度的成像样品;
  • 配备专门的骨密度和骨小梁分析软件;
  • 预留麻醉、生理参数监控接口,方便实验研究;
  • 支持多种图像格式输出,便于与其他模态融合。

Micro-CT扫描设备

Micro-CT投影采集界面

Micro-CT三维重建界面

Micro-CT扫描几何结构

高分辨显微成像流程

使用快速三维重建算法得到被扫描物体的三维体数据,结合数据后处理软件进行三维体数据可视化展示及参数分析。

高分辨快速三维重建

使用基于GPU加速的三维重建算法,实现高分辨快速三维重建。系统支持多种滤波核选择和ROI二次重建,无需再次扫描即可缩短成像时间、降低辐射剂量。

不同重建方法的图像对比

自主研发的骨分析软件BoneView

BoneView软件具备全面的骨骼参数分析功能,可实现皮质骨、骨小梁相关参数和骨体积分数等定量计算。

骨仿体主要成分为羟基磷灰石。通过拟合羟基磷灰石密度值(HA)和X射线衰减系数之间的线性关系,可实现骨密度参数的定量计算。

BoneView提供三维图像旋转和多种ROI区域选择功能,结合辅助线方便选取皮质骨和骨小梁对应区域;一键式的皮质骨和骨小梁全自动分割功能,可分别分析皮质骨和骨小梁相关参数。

骨微结构分析结果

骨形态学参数分析

骨密度标定仿体

双材料仿体成像

皮质骨与骨小梁分割结果对比

Micro-CT生物成像应用

2022年底,该系统在中国科学院昆明动物研究所装机,服务于发改委模式动物表型与遗传研究国家重大科技基础设施(灵长类设施),并开始开展相关生物成像实验,包括大鼠股骨、大鼠颅骨切片与斑马鱼成像。

CT样品表面重建结果

颅骨表面重建结果

全身表面重建结果